Интеллектуалды медициналық зерттеулер институты (IIMR) BGI Genomics Швецияның Упсала университетімен бірлесіп колоректальды қатерлі ісікке (CRC) 33 жаңа мутацияланған драйвер гендерін тапты. Зерттеушілер популяцияға негізделген когортада колоректальды қатерлі ісіктің 1063 негізгі жағдайының бүкіл геномдары мен транскриптомдарын талдады, пациенттердің 94% бес жылдық клиникалық бақылауды аяқтады. Олардың талдауы 96 мутацияға ұшыраған драйвер гендерін анықтады, олардың тоғызы бұрын CRC-де белгісіз болған және олардың 24-і қатерлі ісіктің кез келген түріне жаңа болды.
Зерттеу нәтижелері Nature журналында «Коректальды қатерлі ісіктегі болжамдық геномдық және транскриптомиялық белгілер» атты мақалада жарияланды.
«Коректальды қатерлі ісік қатерлі ісіктің негізгі жолдарындағы драйвер гендеріне әсер ететін соматикалық геномдық өзгерістер тізбегінен туындайды», - деп жазды зерттеушілер. «Мұнда қатерлі ісік тудыратын соматикалық мутациялардың функционалдық және болжамдық әсерін түсіну үшін біз ұзақ мерзімді бақылаумен популяцияға негізделген когортада колоректальды қатерлі ісіктің 1,063 негізгі жағдайының бүкіл геномдары мен транскриптомдарын талдадық. 96 мутацияға ұшыраған драйвер гендерінің 9-ы бұрын тоқ ішек қатерлі ісігімен, ал 24-і қатерлі ісіктің кез келген түрімен байланыспаған. «Мутация жолының екі түрлі үлгісі табылды, уақытша талдау тоғыз ерте және үш кеш жүргізуші гендік мутацияны анықтады және колоректальды қатерлі ісікке тән бірнеше мутациялық белгілер анықталды».
CRC-ге ғана тән бірнеше спецификалық мутациялық үлгілер анықталды. Арнайы жолдардағы мутациялар (WNT, EGFR, TGFβ), митохондриялық ген (CYB), үш реттеуші элемент, 21 көшірме санының вариациясы (белгілі бір геннің көшірме санындағы өзгерістер) және арнайы мутация белгісі (COSMIC SBS44) пациенттердің өмір сүру көрсеткіштері.
Осы нәтижелерге сүйене отырып, зерттеушілер колоректальды қатерлі ісіктің молекулалық жіктелуінің жаңа стратегиясын әзірледі. Мутацияланған гендерді гендердің экспрессия деңгейлерімен біріктіретін жан-жақты талдау арқылы олар әрқайсысының бірегей молекулалық сипаттамалары бар бес түрлі CRC болжамдық қосалқы түрін (CRPS) анықтады. Бұл жаңа жіктеу жүйесі CRC диагностикасы мен емдеу әдісін өзгертуге дайын.
Уақытша талдау арқылы зерттеу белгілі бір генетикалық өзгерістер, мысалы, APC, TP53, KRAS, BRAF, ZFP36L2, TCF7L2, FBXW7, BCL9L және SOX9 өзгерістері қатерлі ісік дамуының ерте сатысында болатынын анықтады. Сонымен қатар, басқа мутациялар, әсіресе TRPS1, GNAS және CEP170, ісік дамуының кейінірек пайда болуы ықтимал.
Ісік инвазиясымен және метастазбен байланысты сыни молекулалық өзгерістерді анықтаумен қатар, зерттеу митохондриялық геномдағы және кодталмаған аймақтардағы аурумен байланысты мутацияларды анықтады, бұл аурудың өршуінде маңызды рөл атқаратын мутациялардың толық жиынтығын ұсынады.
Мутациялар мен экспрессиялық қосалқы типтердің ашылуы колоректальды қатерлі ісікке арналған жеке терапияға бағытталған болашақ күш-жігерді бағыттауы мүмкін.
Дереккөз: genengnews.com
Пікір қосу